Das Auswählen einzelner Zellen in verzerrten Mikroskopiebildern ist jetzt so einfach wie das Klicken auf eine Schaltfläche.
Eine neue Version von Cellpose-das beliebte Werkzeug, das die Grenzen verschiedener Zellen in Mikroskopiebildern ordnet-funktioniert jetzt auf weniger als perfekten Bildern, die laut, verschwommen oder untergetastet sind.
Viele allgemeine Methoden zur Segmentierung einzelner Zellen in Mikroskopiebildern, einschließlich früherer Versionen von Cellpose, haben es schwer, zelluläre Grenzen zu erkennen, die durch Rauschen, Unschärfe oder Unterabtastung verzerrt wurden.
Die Janelia Group Leaders Carsen Stringer und Marius Pachitariu machten sich auf den Weg, um dieses Problem mit der Entwicklung von Cellpose3 anzugehen. Im Gegensatz zu früheren Ansätzen, die Modelle zur Verbesserung der Qualität verzerrter Bilder trainieren, wurde Cellpose3 stattdessen geschult, um die Segmentierung verzerrter Bilder zu verbessern.
Der Cellpose3 -Restaurierungsalgorithmus erzeugt, wenn er auf verzerrte Bilder angewendet wird, knusprige wiederhergestellte Bilder, die dann durch den ursprünglichen Cellpell -Segmentierungsalgorithmus leicht segmentiert werden können.
CellPoSt3 wird auch auf einer großen, abwechslungsreichen Sammlung von Bildern geschult, sodass Benutzer die neue Methode, die als „One-Click“ -Taste in der Cellpose-Anwendung verfügbar ist, für ihre eigenen Daten einfach verwenden kann.
